Le laboratoire de limnologie sert surtout pour l'analyse pigmentaire des échantillons de phytoplancton, de zooplancton et de sédiment grâce à la chromatographie liquide à haute pression (HPLC). On y effectue également des analyses de chlorophylle par spectrophotométrie et spectrofluorométrie.
On y retrouve aussi un incubateur à 4°C où sont entretenues des cultures d'algues nordiques.
Responsables : Warwick Vincent, Connie Lovejoy, Dermot Antoniades